Décryptage des processus d'assemblage du microbiote des graines dans le but de limiter la transmission d’agents pathogènes - l'unam - université nantes angers le mans Accéder directement au contenu
Thèse Année : 2021

Deciphering seed microbiota assembly processes for limiting seed transmission of pathogen

Décryptage des processus d'assemblage du microbiote des graines dans le but de limiter la transmission d’agents pathogènes

Résumé

Seed is the starting point of community assembly of the plant microbiota that supports plant growth and health. Investigation of microbiota structure during development of bean and radish seeds revealed that Selection was the major ecological process involved in community assembly. Host and environmental filtering drove the selection of one dominant taxon, whose identity varied not only between seeds of the same plant but also during the seed developmental stages. Seedling transmission of these dominant taxa was far from being systematic. Analysis of the bacterial genetic determinants involved in seedling transmission of the plant pathogen Xanthomonas campestris pv. campestris (Xcc) revealed that purine biosynthesis was key factor to colonize this habitat. Seed transmission of Xcc can be limited by a seed-borne Pseudomonas strain that produced an atypical pyoverdine when interacting with this phytopathogenic agent. Overall these results pave the way towards the use of seeds as vectors of beneficial organisms for plant growth and health
La graine est le point de départ de l'assemblage des communautés associées au microbiote des plantes et va promouvoir le bon développement et la santé des plantes. L'étude de la structure du microbiote pendant le développement des graines de haricot et de radis a révélé que la Sélection était le principal processus écologique impliqué dans l'assemblage des communautés. Les facteurs de l'hôte et de l'environnement conduisent à la sélection d'un taxon dominant dont l'identité peut varier d'une graine à l'autre au sein de la même plante, mais aussi au cours du développement de la graine. La transmission de ces taxons dominants aux plantules n’est cependant pas systématique. L'analyse des déterminants génétiques bactériens impliqués dans la transmission aux plantules de l’agent phytopathogène Xanthomonas campestris pv. campestris (Xcc) a révélé que la biosynthèse des purines était importante pour coloniser cet habitat. Enfin, la transmission de Xcc par les graines peut être limitée par une souche de Pseudomonas isolée de graines, grâce à sa capacité à produire une pyoverdine atypique lors de l'interaction avec cet agent phytopathogène. En conclusion, ces résultats constituent un premier pas vers l'utilisation de la graine comme vecteur d'organismes bénéfiques pour la croissance et la santé des plantes.
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Origine : Version validée par le jury (STAR)

Dates et versions

tel-03678713 , version 1 (25-05-2022)

Identifiants

  • HAL Id : tel-03678713 , version 1

Citer

Guillaume Chesneau. Décryptage des processus d'assemblage du microbiote des graines dans le but de limiter la transmission d’agents pathogènes. Microbiologie et Parasitologie. Université d'Angers, 2021. Français. ⟨NNT : 2021ANGE0047⟩. ⟨tel-03678713⟩
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